Контроль качества осуществляется на каждом этапе фармацевтического производства, начиная с входного контроля сырья, вспомогательных материалов, полупродуктов, упаковочных и маркировочных материалов, межоперационного контроля в процессе производства и заканчивая контролем готовой продукции.  

Для оценки эффективности действующей системы обеспечения качества постоянно проводятся самоинспекции, по итогам которых рарабатываются необходимые корректирующие и предупреждающие мероприятия. 

Для компании характерен высокий уровень организации производства и контроля качества, соответствующих действующим российским стандартам.  

В 2007 году специалистами ОАО «Мосхимфармпрепараты» им. Н. А. Семашко» были рецензированы Общие фармакопейные статьи на методы контроля качества лекарственных средств по просьбе Росздравнадзора, которые будут включены в Государственную Фармакопею XII издания.  Предоставленная предприятием экспертная информация имеет государственную важность и будет в дальнейшем использована как инструкция к действию всеми российскими фармацевтическими производителями. 

Обеспечение конкурентоспособности ОАО «Мосхимфармпрепараты» им. Н. А. Семашко» среди производителей лекарственных средств основано на проведении четкой политики в области качества. 

Главная цель ОАО «Мосхимфармпрепараты» им. Н. А. Семашко»  – выпуск качественной продукции, отвечающей критериям безопасности, эффективности и соответствующей требованиям нормативной документации и запросам потребителей. 

Гарантом качества продукции является ответственность руководства ОАО «Мосхимфармпрепараты» им. Н. А. Семашко», высокий профессионализм и квалификация персонала, использование прогрессивных методов анализа и испытаний.